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某麻类作物基因组测序项目招标公告

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日期:2018-05-02

  根据科研工作需要,拟对“某麻类作物基因组测序项目”进行公开招标,现就有关事宜公告如下:

  一、项目名称:中国农业科学院麻类研究所某麻类作物基因组测序项目

  二、项目主要内容、数量及要求:
     本项目主要对某麻类作物基因组进行测序。此次招标项目含DNA/RNA提取,建库测序,常规及个性化生物信息分析等内容。具体测序项目和指标要求如下表:

  项目名称:

 服务内容

 测序平台

 周期

  分析指标和内容

  三个基因组Survey

  Illumina PE150

 30天

  测序100 x,初步组装

  二倍体,三代基因组测序、组装、Hi-C完成染色体构建、注释分析

  PacBio sequl

 6个月

  三代数据不低于100 x,总数据量不低于50GbHi-C测序100 x,至少96%序列定位到染色体,Contig N50 2Mbscaffold N50 15MbHi-C辅助组装纠错,和组装效果评估,Hi-C辅助组装单倍体构建

  同源三倍体,三代基因组测序、组装、Hi-C完成染色体构建、注释分析

  PacBio sequl

 6个月

  三代数据不低于100 x,总数据量不低于150GbHi-C测序100 xContig N50 1Mb;同源三倍体,序列拆分需要≥ 80%

  基因组比较分析

  

  

  转录因子、生殖基因等基因家族鉴定;物种系统发育树构建,计算物种分歧时间,基因组变异分析(SNVs, indels and PAVs);基因组共线性分析;全基因组复制分析;基因家族扩张和收缩;选择压力分析,趋同进化分析等

  合计

  

10个月

  

  

  三、采购方式:

  投标截止时间:至发布之日起7个工作日。

  交付日期:项目签订后10个月内完成结果交付。
     交付地点:中国农业科学院麻类研究所

  四、投标报名资格:

  (1)在中华人民共和国境内注册、注册资金为人民币50万元(含)以上、具有履行合同的能力和良好的履行合同记录、具有良好的财务状况和商业信誉、具有独立承担民事责任的法人或其他经济组织。

  (2)具备独立出具测序分析报告的能力。

  (3)投标人近三年来承担过类似项目。需提供近3年至少两个以上业绩证明文件、成交通知书、合同等原件。

  (4)法定代表人为同一个人的两个及两个以上法人,母公司、全资子公司及其控股公司,只能有一家参加同一包的投标。

  (5)本次招标不接受联合体投标。

  五、参与竞争性谈判的费用:

  投标人应承担所有与准备和参加本项目有关的费用。不论谈判结果如何,采购人均无义务和责任承担这些费用。

  六、招标会议时间和地点:

  时间为5月,具体另行通知;

  地点为中国农业科学院麻类研究所所部大楼,要求竞标人到会。

  七、标书、竞标材料及审查:
  报名时投标人须提供营业执照、税务登记证、组织机构代码证、法人授权委托书、资质证书、业绩证明、报价单等材料,现场或邮件审核。标书售价:人民币300元/份。  

  八、联系人相关信息:

  采购人名称:中国农业科学院麻类研究所

  地址:湖南省长沙市岳麓区咸嘉湖西路348号

  联系人:唐老师  /黄老师

  联系电话:073188998507/ 88998521

  邮箱:ibfckyc@163.com

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