一、服务内容及要求

利用基于液相捕获精准定位测序技术对4000份两个亚种麻类种质资源进行精准定位。

（1）两款液相芯片开发:首先利用现有两个亚种麻类种质材料重测序数据，根据位点质量、多态性、密度、均匀性等原则，筛选10K以上具有代表性的全基因组SNP位点，设计合成探针。

（2）两款麻类液相芯片合成后，然后首先用96个样品进行体系验证，体系通过验证后，再对4000份麻类种质资源进行基因分型，从而对4000份麻类种质资源进行精准鉴定。

（3）检测完成后，构建分子身份证、群体结构，分析亲缘关系、PCA和LD。整理相关内容形成最终的产品开发报告和种质鉴定结果。

二、验收要求和标准

1．DNA提取：完成提取后的样品，用Qubit检测双链浓度，用1%琼脂糖胶随机抽样检测DNA的纯度和完整性。保证DNA样品纯度A260/280在1.8-2.0范围内，保证DNA样品达到检测要求。将DNA稀释至相同浓度（20ng/uL）

2.液相芯片技术体系开发：液相芯片变异位点筛选指标，测序深度≥5X的变异位点为检测成功位点，＜5X为缺失位点；区域覆盖度>95%,均一性>90%，目标位点平均检出率>90%。

3.液相芯片基因分型：DNA样本经质控后，按文库构建流程，进行文库构建。文库浓度检测采用Qubit，文库质量检测采用Agilent 2100/2200 Bioanalyzer，文库质检合格后，采用T700高通量测序平台进行样本的检测与深度分析。

4.数据生信分析：高通量测序后的原始数据经过质控过滤等处理，去除含有接头污染的Reads和低质量的Reads。应用BWA软件与麻类参考基因组进行比对。使用IGV与参考基因组对比查看变异。

5.数据成果交付存储：项目过程中的数据、文件、结果等，可使用电子邮件、百度网盘、FTP、硬盘邮寄等方式提供；在最终数据交付后，继续免费存储数据45天。

三、检测质量

1、严格按照标准方法进行检验；

2、样品流转及测定原始记录清晰可查；

3、甲方可参与送检样品的分析检测现场抽查，查阅送检样品的原始记录；

4、对于甲方提出疑问的数据，核实原始数据后进行复检；

5、对于有疑义样品，进行不少于5%样品数量的抽检。

四、检测实效

甲方送检样品在乙方承检能力范围内的，送检样品的检测进程和出据检测报告时间由甲乙双方共同协商以书面形式确定。

         五、服务承诺及保证措施

1、乙方承诺提供如下服务承诺：

(1)严格执行国家有关产品质量监督检验的各项法律、法规、政策和有关标准、技术规程，绝不在任何利益驱动下偏离国家法律法规和技术标准。

(2)坚持科学、公正、廉洁、高效、优质服务的原则，严守职业道德和质检纪律，严肃对待各项检测工作，坚持实事求是，廉洁奉公，秉公办事，确保检测数据科学、准确、公正，承担所提供社会公正数据的法律责任。

(3)严格按照国家标准、行业标准和技术规范进行检测，相应的检测仪器、设备、计量器具均须检定或校准合格后方可使用，环境条件均满足检测工作要求，检测人员均通过培训合格后持证上岗。

(4)恪守第三方公正立场，保证不受任何内部和外部的商务、财务和其它压力的影响和干预。

(5)严格遵守保密制度，对甲方提供的技术资料、样品、检测数据实行保密，并为用户严格保守生产和技术秘密，乙方所有检测人员和管理人员不得从事所检测产品的技术咨询和技术开发工作。

(6)乙方管理者坚守检测数据公正、准确和可靠的原则，决不干预业务部门及其实验室按照有关法律法规和技术标准独立开展检测的活动。

2、乙方保证措施：

（1）保证每一次送检样品的送检记录规范，信息清楚；

（2）保证数据检测原始记录完整，检测活动和所用检测仪器设备、计量器具、标准物质可溯源至国家计量基标准；

（3）保证对检测样品的抽取、接收、登记、制备、标识、处理、贮藏等环节进行有效控制，确保样品的代表性、真实性、完整性和检测结果的有效性、准确性及检测工作的顺利进行；

（4）通过对检测结果质量实施有效控制，确保检测结果的准确性，有效性；

（5）按规定程序对检测报告的编制、审核、审批、发送予以控制，保证检测报告的严肃性、合法性，对检测结果负责，对甲方负责。

（6）乙方按照国家或行业样品保存规范保存甲方送检样品，若甲方对样品保存有特殊要求，双方协商约定保存方式及时间等，若无特殊要求则乙方保留60个工作日后自行销毁处理。

（7）若甲方有加急样品需检测，双方协商约定检测时限，乙方应在能力范围内尽量解决。

（8）若甲方对乙方提供的检测数据有异议，乙方对数据进行抽检核实后7个工作日给甲方答复，若需要复检的乙方应根据复检样品指标数量以最短时间确定时限，复检费用由乙方承担。

乙方应提供及时的服务管理，服务管理电话：

六、售后服务要求

组建技术团队提供技术服务，提供相关的进展报告，协助数据亮点挖掘。

七、投标人资格要求

3.1投标人须具有独立承担民事责任的能力,在中华人民共和国境内注册的法人或者其他组织，提供有效的营业执照；

3.2投标人具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度，提供近三年（2020-2022年或2019-2021）财务报表。【注：成立不足3年的，则提供成立至今的财务报表（包括但不限于资产负债表、现金流量表、利润表）；若为2022年新成立的公司，提供银行开具的资信证明文件或财务报表。】

3.3投标人近三年（2020年至今）至少具有1项麻类液相芯片开发及检测项目业绩；

八、招标会议时间和地点：

时间为六月中下旬，具体另行通知；

地点为中国农业科学院麻类研究所所部大楼，要求竞标人到会。

七、竞标材料及审查： 报名时投标人须提供营业执照、税务登记证、组织机构代码证、法人授权委托书、资质证书、业绩证明等材料，现场或邮件审核。

八、联系人相关信息：

采购人名称：中国农业科学院麻类研究所

地址：湖南省长沙市岳麓区咸嘉湖西路348号

联系人：孙老师/黄老师

联系电话：073188998507

邮箱：ibfckyc@163.com